Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms