Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Filip1Q9CS72 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms