Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3bpQ9CQ82 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms