Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms