Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms