Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW4

Arpc5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5Q9CPW4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arpc5Q9CPW4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arpc5Q9CPW4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arpc5Q9CPW4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arpc5Q9CPW4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arpc5Q9CPW4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arpc5Q9CPW4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arpc5Q9CPW4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arpc5Q9CPW4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arpc5Q9CPW4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Arpc5Q9CPW4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Arpc5Q9CPW4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Arpc5Q9CPW4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Arpc5Q9CPW4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arpc5Q9CPW4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms