Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ssxb1Q9CPU1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ssxb1Q9CPU1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ssxb1Q9CPU1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ssxb1Q9CPU1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ssxb1Q9CPU1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ssxb1Q9CPU1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ssxb1Q9CPU1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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