Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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