Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl1Q99N96 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms