Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms