Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms