Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Sh3bp5lQ99LH9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Sh3bp5lQ99LH9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Sh3bp5lQ99LH9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Sh3bp5lQ99LH9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sh3bp5lQ99LH9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp5lQ99LH9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp5lQ99LH9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp5lQ99LH9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp5lQ99LH9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp5lQ99LH9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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