Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms