Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pagr1aQ99L02 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms