Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms