Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms