Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spef1Q99JL1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Spef1Q99JL1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms