Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms