Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim11aQ99J19 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Smim11aQ99J19 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Smim11aQ99J19 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Smim11aQ99J19 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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Smim11aQ99J19 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Smim11aQ99J19 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Smim11aQ99J19 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Smim11aQ99J19 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Smim11aQ99J19 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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