Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms