Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms