Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Afg3l1Q920A7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Afg3l1Q920A7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Afg3l1Q920A7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Afg3l1Q920A7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Afg3l1Q920A7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Afg3l1Q920A7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Afg3l1Q920A7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Afg3l1Q920A7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Afg3l1Q920A7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Afg3l1Q920A7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 807.7 ms