Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf6Q91YR7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf6Q91YR7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms