Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx15Q91WE1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx15Q91WE1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms