Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csde1Q91W50 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csde1Q91W50 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms