Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms