Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsx1Q91V10 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms