Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Smg8Q8VE18 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smg8Q8VE18 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg8Q8VE18 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg8Q8VE18 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg8Q8VE18 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg8Q8VE18 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg8Q8VE18 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg8Q8VE18 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg8Q8VE18 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg8Q8VE18 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg8Q8VE18 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smg8Q8VE18 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
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