Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VCE4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q8VCE4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VCE4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VCE4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VCE4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VCE4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VCE4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q8VCE4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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