Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med17Q8VCD5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms