Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BbxQ8VBW5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms