Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpm8Q8R4D5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpm8Q8R4D5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpm8Q8R4D5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpm8Q8R4D5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpm8Q8R4D5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms