Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms