Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f4Q8R0K9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f4Q8R0K9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f4Q8R0K9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f4Q8R0K9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f4Q8R0K9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f4Q8R0K9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f4Q8R0K9 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f4Q8R0K9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f4Q8R0K9 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f4Q8R0K9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f4Q8R0K9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f4Q8R0K9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f4Q8R0K9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f4Q8R0K9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f4Q8R0K9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f4Q8R0K9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms