Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms