Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hecw1Q8K4P8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hecw1Q8K4P8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms