Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms