Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MyripQ8K3I4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms