Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk5rap2Q8K389 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms