Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncapd2Q8K2Z4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms