Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud6bQ8K2H2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms