Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd3Q8K1Y2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms