Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FgbQ8K0E8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms