Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LgsnQ8CIX8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LgsnQ8CIX8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms