Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Setd1bQ8CFT2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setd1bQ8CFT2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms