Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms