Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms