Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Nhlrc3Q8CCH2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nhlrc3Q8CCH2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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