Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Atg4aQ8C9S8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Atg4aQ8C9S8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Atg4aQ8C9S8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Atg4aQ8C9S8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4aQ8C9S8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Atg4aQ8C9S8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg4aQ8C9S8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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Atg4aQ8C9S8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg4aQ8C9S8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Atg4aQ8C9S8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Atg4aQ8C9S8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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