Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe22Q8C6A8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms